Fakulta mechatroniky, informatiky a mezioborových studií vznikla v roce 1995 jako fakulta zaměřená především na obory kombinující technické disciplíny (elektroniku, řízení, měření) s informatikou a přírodními vědami (matematické modelování).
V současnosti poskytujeme vzdělání na všech vysokoškolských úrovních - od bakalářského až po doktorské - a máme právo habilitačního řízení a řízení ke jmenování profesorem v oborech Technická kybernetika. Vedle výuky se fakulta výrazně angažuje v oblasti vědy a výzkumu.
Základním kamenem její vnitřní struktury jsou ústavy, jež zajišťují vědeckou, výzkumnou a pedagogickou činnost. V současnosti fakulta zaměstnává přibližně 150 zaměstnanců a její obory studuje kolem 800 studentů.